角膜移植术中的角膜缝合技术并发症可分为术中并发症和术后并发症两种。
术中并发症可包括虹膜晶状体式光阑前移、虹膜脱出导致缝合中断并出现潜在的晶状体损伤或排出。最可怕的并发症是脉络膜上腔出血，这种并发症可以进展到驱逐性脉络膜出血，导致眼内容脱出。术中并发症还包括违反或接触晶状体前囊膜，从而导致外伤性白内障；切除患病角膜时无意间切除虹膜组织；以及由于组织操作或处理技术不当造成的对供体内皮的损伤。缝合线位置不当可导致虹膜嵌箝顿、晶状体缺陷（lensviolation）以及会有术后缝合脓肿或患眼内炎的风险。缝合线张力不当会导致超出预期的散光或供体受体失配，这会导致缝合完成后，很难产生水密性的创口，还会导致术后出现明显的散光性屈光不正。
虽然经验丰富的角膜外科医生通常可以使术中并发症降至最低，但是术后并发症种类繁多且经常发生。角膜移植术中缝合技术的术后并发症包括：前房平坦导致的创口渗漏、前房积血、外伤性白内障、虹膜嵌箝顿、周边虹膜与植片-供体连接处粘连、继发性青光眼以及角膜后薄膜。术后即刻或后期缝合松动可能导致缝合线血管化或创口开裂。特别是，据一项研究显示，24针SCS（单连续缝合技术）中有7.2％的患者会发生手术后期创口开裂，多数病例发生在缝合线拆除后的2周内。创口开裂通常在拆除缝合线后很快发生，然而据报道，手术后期创口开裂有在拆除缝合线后10-19年发生的情况。
眼内炎、缝合脓肿和植片溃疡等感染也可能与缝合线松动有关。角膜移植术后表面角膜病是继散光之后最常见的术后并发症之一。它可以以多种形式呈现，包括飓风角膜病（hurricanekeratopathy）、丝状角膜病变（filamentarykeratitis）、药物性角膜炎（keratitismedicamentosa）、持续性角膜上皮缺损（persistentepithelialdefects）和浅层肥厚性树枝状上皮病变（superficialhypertrophicdendriformepitheliopathy）（SHDE）。这些表面并发症会间接影响缝合线，并且需要观察潜在的缝合线融解或渗透。
散光是角膜移植术中最常见的与术后缝合相关的并发症。加重高度散光的风险因素包括施加在眼球上的外部压力过多，例如开睑器过紧或巩膜固定环使用不当。与散光相关的其他因素包括环钻步骤不当、供体受体失配、缝合线松紧不当、缝合线深度不一致、缝合线非放射状分布、缝合线分布不对称以及/或者基础缝合线定位错误。
美国MASTEL手术导航角膜镜（ISK）结合一处闪光固视中心点和LED环形灯排，可在角膜移植手术过程中呈现出角膜像差的位置（散光情况），使医生获取低至（或低于）一个屈光度的角膜散光度。在提供精确定中效果的同时为角膜移植时缝线操作形成导航，使失误率降至最低。
表1各种缝合技术中最终平均角膜散光的比较
（注：IS：间断缝合技术；CICS：间断缝合和连续缝合相结合技术；SCS：单连续缝合技术；DCS：双连续缝合技术；D：屈光度）
尽管在过去十年中角膜手术取得了大幅度进展，但是理想的缝合技术还有待探索。尽管我们在医疗器械、手术技术、免疫生物学知识等各方面取得了进展，但是角膜手术和角膜移植术这两个特殊领域还未取得十全十美且可广泛应用的成果。尽管常规情况下穿透性角膜移植术的成功率一般在90％以上，但是术中和术后并发症始终仍然是角膜手术的一大风险。尽管当代角膜移植术越来越多地获得了成功，但是与缝合相关的并发症仍然存在。
虽然确实存在这些风险，但是只要注意采用适当的缝合技术，并且角膜手术后对患者进行仔细、密切的跟踪，散光、创口崩裂和缝合相关的感染等术后并发症是可以减轻的。尽管如此，对于角膜外科医生来说，掌握角膜创口闭合和适当的组织对合的知识是十分根本且必要的。
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